1. Giới thiệu sơ lược về phần mềm tính toán (hóa học lượng tử) và bán kinh nghiệm2. Cài đặt phần...

Câu hỏi:

1. Giới thiệu sơ lược về phần mềm tính toán (hóa học lượng tử) và bán kinh nghiệm

2. Cài đặt phần mềm MOPAC

3. Thực hiện tính và hiển thị kết quả

Luyện tập: Tính lại cấu trúc của C6H5OH trong dung môi nước. Các giá trị nhiệt tạo thành, năng lượng tổng, độ dài liên kết O-H và góc liên kết HOC là bao nhiêu? 

Câu trả lời:
Người trả lời: GV. Đỗ Đăng Hạnh
Câu trả lời chi tiết và đầy đủ hơn cho câu hỏi trên là:
Bước 1: Sử dụng phần mềm ChemSketch để vẽ cấu trúc 2D của phenol (C6H5OH). Sau đó chọn Tool và chọn 3D Structure Optimization để tối ưu hóa cấu trúc.
Bước 2: Trong phần 3D Viewer, chọn File và Save As, đặt tên file là C6H5OH và lưu dưới dạng .mop (chọn MOPAC Z – Matrix) trong một thư mục không có đường dẫn bằng tiếng Việt.
Bước 3: Mở file C6H5OH.mop bằng Notepad và thêm lệnh "OPT EPS=78.4" và "ENPART" để xác định cấu trúc và năng lượng, sau đó lưu lại.
Bước 4: Nháy đúp chuột vào file C6H5OH.mop để chạy chương trình MOPAC (nếu cần, mở bằng MOPAC2016.exe trong thư mục C:\Program Files\MOPAC). Sau khi chạy, sẽ xuất hiện 2 file mới là C6H5OH.out và C6H5OH.arc.
Bước 5: Mở file C6H5OH.out bằng Notepad để xem kết quả. Giá trị nhiệt tạo thành trong dung môi nước là -117,65887 kJ/mol và năng lượng tổng là -1112,9781 EV.
Để hiển thị cấu trúc 3D của phenol, mở file C6H5OH.arc.mop trong 3D Viewer và chọn MOPAC Z – Matrix. Để biết độ dài liên kết O-H, và góc liên kết HOC, chọn công cụ thích hợp và nhấp vào các nguyên tử tương ứng trên cấu trúc 3D. Kết quả sẽ cho độ dài liên kết O-H là 0,999 Å và độ góc liên kết HOC là 112,748 độ.
Bình luận (0)
Nhấn vào đây để đánh giá
Thông tin người gửi
0.58346 sec| 2229.906 kb